Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms