Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcom1E9PZ54 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms