Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931408C20RikE9PWP9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms