Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms