Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms