Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh8D3Z6W3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms