Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb3D3Z6J4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms