Protein–RNA interactions for Protein: D3YYY1

Scgb2b7, ABPBG7, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b7D3YYY1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scgb2b7D3YYY1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scgb2b7D3YYY1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms