Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc170D3YXL0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc170D3YXL0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms