Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd1D3YXK1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd1D3YXK1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms