Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d4D3YUH6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms