Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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