Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6133B2RY53 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms