Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah3B2RWG3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah3B2RWG3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah3B2RWG3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah3B2RWG3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah3B2RWG3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah3B2RWG3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Siah3B2RWG3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah3B2RWG3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms