Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5483B2RV77 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5483B2RV77 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5483B2RV77 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5483B2RV77 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5483B2RV77 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5483B2RV77 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5483B2RV77 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5483B2RV77 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5483B2RV77 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5483B2RV77 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5483B2RV77 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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