Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AU015836B2RUM3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AU015836B2RUM3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AU015836B2RUM3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AU015836B2RUM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AU015836B2RUM3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AU015836B2RUM3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AU015836B2RUM3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms