Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprbB2RU80 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms