Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brpf1B2RRD7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms