Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf3B2KF05 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf3B2KF05 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms