Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trabd2bB1ATG9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trabd2bB1ATG9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trabd2bB1ATG9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trabd2bB1ATG9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trabd2bB1ATG9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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