Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spocd1B1ASB6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms