Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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