Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rtf1A2AQ19 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rtf1A2AQ19 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rtf1A2AQ19 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rtf1A2AQ19 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rtf1A2AQ19 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms