Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frmpd4A2AFR3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms