Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calcoco2A2A6M5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms