Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
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