Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Speer3W4VSP1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms