Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mrpl40Q9Z2Q5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl40Q9Z2Q5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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