Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Knop1Q9Z2Q2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms