Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syngr4Q9Z1L2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms