Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod1Q9R0E2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Plod1Q9R0E2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms