Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf346Q9R0B7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms