Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lamc3Q9R0B6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms