Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fhl3Q9R059 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms