Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms