Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms