Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms