Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChmQ9QXG2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms