Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim44Q9QXA7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim44Q9QXA7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms