Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer2Q9QWW1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer2Q9QWW1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms