Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col5a3Q9JLI2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Col5a3Q9JLI2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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