Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CtsmQ9JL96 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CtsmQ9JL96 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms