Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms