Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timp4Q9JHB3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms