Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn3Q9ES97 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rtn3Q9ES97 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rtn3Q9ES97 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn3Q9ES97 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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