Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trhr2Q9ERT2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms