Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cse1lQ9ERK4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms