Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clstn2Q9ER65 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms