Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn12Q9ER56 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms