Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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SgshQ9EQ08 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SgshQ9EQ08 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SgshQ9EQ08 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms